王秀玲在山间的照片

微生物生态 · 微生物组数据 · 可复现研究

王秀玲

微生物生态与微生物组研究者

我研究气候与土壤深度梯度中的微生物群落,结合低生物量分子方法、R 统计分析与生态解释。

欢迎微生物生态、微生物组科学与土壤微生物研究领域的合作与交流。

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01

简介

我的研究结合地理学、生态学与微生物组分析。博士研究依托波茨坦大学、德国亥姆霍兹地学研究中心(GFZ)及德国—智利 EarthShape 项目,研究干旱至湿润气候梯度和土壤深度如何影响细菌与古菌群落,结合低生物量样品处理和胞内/胞外 DNA 分离分析。合作研究还涉及根际与食用菌表面微生物组。

我的主要工作涵盖实验设计、低生物量样品 DNA 提取、qPCR、群落统计分析、科学可视化和论文写作。宏基因组研究中,我侧重下游分析和生态解释,与合作者完成的上游生物信息分析衔接。

我关注微生物活动及微生物残体如何与矿物相互作用,进而影响土壤碳循环,希望将群落格局与基因组功能潜力联系到其背后的生物地球化学过程。

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专业背景微生物学博士研究 · 生态学理学硕士 · 地理科学理学学士
国际项目DFG EarthShape · 德国—智利 · 项目周期:2018–2025
工作语言中文(母语)· 英语
02

核心能力

将实验、数据与生态问题连接起来。

01

气候梯度与深层土壤微生物

沿智利干旱至湿润梯度,研究气候、土壤深度与理化性质如何共同塑造细菌和古菌群落。

02

胞内与胞外 DNA 分级

分离胞内 DNA(iDNA)与胞外 DNA(eDNA),提高低生物量环境中群落生态解释的准确性。

03

根际与食品微生物生态

从药用植物根际群落到食用菌保鲜,研究微生物群落与植物、环境及生产过程的联系。

04

微生物组数据与统计

使用 R 整理数据、分析群落差异与环境关联,并将结果转化为可核验的图表和科学论证。

03

代表项目

EARTHSHAPE · DFG · 项目周期:2018–2025

德国—智利 EarthShape BIOSOILS 合作项目

个人参与:2019年10月–2024年12月。参与跨气候区深层土壤研究,围绕气候、土壤深度与微生物群落开展实验和数据分析;优化低生物量土壤 DNA 提取方案,相关流程被 GFZ 实验室采用。
iDNA / eDNA16S rRNA0–200 cmGermany–Chile
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02

阿魏属植物的根际真菌群落

不同阿魏物种原生生境中的根际真菌群落如何变化?

ITS · Community ecology · R

我的贡献:以第一作者及通讯作者身份完成研究与论文写作,连接群落数据分析与根际生态问题。

发表于 Rhizosphere,2026
03

智利土壤宏基因组与环境梯度

土壤微生物功能潜力如何随环境条件和土壤深度变化?

Metagenomics · Functional profiles · R

我的贡献:负责下游数据分析、统计、生态解释与论文写作;上游生物信息分析由合作者完成。

已投稿 Environmental Microbiome

04

学术成果

进行中的稿件

  1. 01
    2026一作 & 通讯外审中

    Soil archaeal communities in intra- and extracellular DNA share broad regional patterns but diverge locally along the Chilean Coastal Cordillera

    Xiuling Wang, Alexander Bartholomäus, Lars Ganzert, Thomas Friedl, Rómulo Oses, Dirk Wagner

    外审期刊:Applied Soil Ecology

  2. 02
    2026一作 & 通讯已投稿

    Regional differentiation and genomic context of microbial resource-use potential along the Chilean Coastal Cordillera

    Xiuling Wang, Alexander Bartholomäus, Sizhong Yang, Thomas Friedl, Rómulo Oses, Dirk Wagner

    已投稿期刊:Environmental Microbiome

  3. 03
    2026二作准备中

    Pseudomonas araucana sp. nov., a novel species of the family Pseudomonadaceae isolated from forest soil under humid temperate climate

    Sophia Guhr, Xiuling Wang, Julia Mitzscherling, Daniel Lipus, Alexander Bartholomäus, Kai Mangelsdorf, Rómulo Oses, Dirk Wagner

    拟投稿期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology

05

履历

教育经历

微生物学博士研究

波茨坦大学 · 博士论文进行中。

生态学硕士

石河子大学 · 微生物生态

地理科学理学学士

郑州师范学院

研究经历

博士论文与合作研究 · 中国

学位论文整合、合作稿件分析与修订。

博士研究与科研驻留

德国亥姆霍兹地学研究中心(GFZ)· 地球微生物学 · 波茨坦

科研实习

上海市农业科学院食用菌研究所

06

技能

微生物组分析、生态统计、分子实验与可复现研究流程。

统计与微生物组数据分析

开展微生物群落与网络分析、多变量统计和科学可视化,将群落与环境数据转化为生态解释。

Ecological statisticsCommunity analysisNetworksVisualisation

R 语言与可复现计算分析

熟练使用 R,具有约 5 年使用经验(2021–至今),覆盖数据整理、统计建模、微生物群落分析和可视化,常用 tidyverse 与 ggplot2 等 R 包。

Rtidyverseggplot2Reproducible analysis

微生物生态实验

低生物量土壤 DNA 提取、胞内/胞外 DNA 分离、PCR、qPCR、文库制备及微生物分离培养;具备 16S/ITS 扩增子上游与下游分析、宏基因组下游分析经验。

16SITSMetagenomicsqPCR

计算工作流与 AI 辅助研究

AI 辅助编程与可复现工作流。

合作与联系

研究机会与合作

欢迎微生物生态、微生物组科学与土壤微生物研究领域的合作与交流。